秘卷的选择直接影响决斗场的胜负走向。霸体和散作为底层逻辑秘卷，几乎适用于所有版本和忍者，具备免疫控制和打断效果的霸体尤其适合近战突脸型忍者，而散则能有效应对敌方先手压制。这两种秘卷的泛用性使其成为多数玩家的基础配置，但需注意高等级霸体持续时间更长，实战中需结合冷却时间合理规划使用时机。
来去手里剑和烈焰弹是当前版本强势的功能性秘卷。来去手里剑凭借超长X轴和Y轴范围，能实现视野外起手或压制敌方走位，尤其对须佐佐助等忍者有针对性效果，但需精准预判僵直时间以衔接连招。烈焰弹则兼具反手与先手能力，其追踪特性可拖过敌方替身无敌时间，Y轴错位释放时能有效限制对手行动，适合缺乏稳定起手技能的忍者携带。
风遁·风杀阵和查克拉秘卷侧重战术辅助。风杀阵的吸附效果可控制战场节奏，既能打断敌方技能后摇，也能配合己方技能实现错位先手，是控场型忍者的优选。查克拉秘卷则通过增加奥义点解决替身或奥义衔接问题，尤其适合依赖奥义爆发的忍者，但需注意其使用时机避免被敌方反打。这两类秘卷对操作意识要求较高，需结合忍者特性灵活搭配。
木遁·扦插之术和雷电击属于高风险高收益的选择。扦插能将敌人固定3秒，为高爆发技能创造输出窗口，但范围有限且易被躲避；雷电击则依赖精准的范围把控，可电击倒地目标实现起手，但对迪达拉等特定忍者有显著克制效果。这类秘卷需通过大量练习掌握释放节奏，否则容错率较低。
秘卷的强度并非绝对，需根据忍者特性、对手阵容和地图机制动态调整。例如近战忍者优先考虑霸体或突进类秘卷，远程消耗型忍者则适合风杀阵等限制走位的选择。玩家应通过实战测试不同组合的效果，而非盲目追随热门配置。
