飞船升级是提升战力的核心途径，主要通过装备强化、科技研发、技能学习三个方向实现。进入飞船详情界面后，玩家可在装备模块消耗神秘矿石升级武器或防御组件，矿石可通过挖矿或交易获取；科技模块需投入科研点数提升整体性能，包括移动速度、攻击力等基础属性；技能模块则依赖经验点解锁特技，经验通过日常探索和战斗积累。每次升级均会消耗飞船能量，需及时补充燃料矿石以维持升级进程。
飞船功率是升级的基础限制条件，需通过多种方式提升上限。辅助能源核心组件可直接增加功率百分比，工程科技中的系统反应堆研究能永久提升所有舰船功率。若功率长期不足，可考虑更换更高阶的T2/T3舰船，这类舰船基础功率更高且能搭载高级装备。功率分配需遵循单类型专精原则，初期建议集中强化粒子炮等单一武器系统，避免资源分散导致性能失衡。
科技等级与舰船品质共同决定升级上限。纵向升级指从护卫舰到战列舰的舰种进阶，横向升级则是T1至T3的科技等级提升及R1到R5的品质强化。高等级舰船需通过驾照考核解锁，建议优先考取能驾驶更高阶舰船的通用驾照，而非追求单一舰型的顶级驾照。科技研发应优先投资基础物理学至LV.5，解锁护盾抗性强化技术，再转向军事工程学提升武器射程和修复效率。
护盾回充器需搭配电容扩容模块，确保每秒恢复量不低于45单位；武器系统升级后需测试能耗比，避免因能量枯竭导致战斗瘫痪。遭遇高威胁目标时，优先击毁具备跃迁干扰能力的敌舰，确保撤退路线畅通。虫洞等高危区域建议携带跃迁稳定插件，防止被反跃迁装置锁定。武器掌控领域提升暴击率与射程，防御操作强化护盾抗性，电子工程优化能耗效率，飞船操控增加机动性。技能点分配应前期侧重武器伤害与护盾上限，后期根据战斗风格调整。需注意舰长等级受指挥官等级限制，需同步提升才能解锁高级技能。记忆移植体是提升舰长等级的关键道具，可通过任务或活动获取。
