获得殁世机甲是进行武器配置的前提，玩家需要先完成灵魂纷争系列任务以解锁位于火卫二殁世幽都的殁世械灵集团，通过提升该集团声望并准备相应材料后，方可在飞船中制作属于你自己的殁世机甲。殁世机甲的武器选择并非孤立存在，它深受机甲配卡方案的直接影响。一套基础的、侧重于生存与效率的配卡方案，其设计思路就是以保证机甲功能实现为主，此时对武器输出的极致追求并非首要目标。而在进行了更多极化、资源投入更深的高级配卡方案下，机甲的承载能力大幅增强，这使得为其搭配更强大的武器以应对更高强度的战斗成为可能，武器的选择范围与重要性也随之提升。
具体到武器层面，殁世机甲使用空战枪械作为其主武器。在游戏进程中，机甲初始会附带一把名为钩铳的武器，该武器在搭配相应模组后，能够满足如奥影之毒等特定活动的基本作战需求。当玩家追求更高性能时，可以考虑更换其他武器，例如具有范围攻击能力的赤毒怒雷常被用于自动化或清场场景，而威洛斯图或黑鸦系列武器则在对阵大型头目如大蜘蛛时表现出色。像棱晶将军手炮这类面板伤害出众的武器也是高等级配置下的可选方案之一。
武器的最终效能需要通过模组系统来强化和定制。玩家可以为武器安装增加基础伤害、暴击率、触发几率或特定元素伤害的模组，这些模组是提升武器输出的基础。针对不同的敌人类型，调整武器所搭配的元素伤害组合是必要的，例如在面对夜灵平野的巨力使时，可能会选择辐射伤害配装，而在其他场合则可能更换为腐蚀伤害。
在实际使用殁世机甲与武器时，需了解其独特的操作机制。机甲拥有独立的技能和基于燃料条的机动系统，玩家可以在所有开放地形中召唤它进行作战。机甲武器采用空战模式的装填机制，即在停火一段时间后自动回复弹药。机甲的生存能力主要依靠其自身的护盾与生命值，它无法从大部分战甲技能中获益，但可以受益于某些特定的回复效果或道具。
