水晶碎块是困难模式下的重要制作材料，主要用于合成高级装备、魔法武器及功能性物品。其自然生成于地下神圣之地的珍珠石块或粉冰雪块上，呈现粉色、紫色或蓝色，会发出微弱光芒但不会传播神圣环境。玩家可通过破坏生长完成的水晶碎块获取，或利用水、熔岩加速其生长过程。天赐匣有50%概率开出4-10个水晶碎块，而任天堂版本中大恶魔必定掉落3-4个。
水晶碎块的核心用途集中在制作系统。徒手即可合成水晶镖，无需工作台；与其他材料组合可制作水晶块、水晶风暴法杖、彩虹魔杖等魔法武器，以及珍珠流沙染料、强效治疗药水等消耗品。不同颜色的晶光刃需消耗大量水晶碎块，制作全部颜色晶光刃需365个。其合成产物普遍具有高伤害或特殊效果，例如水晶风暴法杖能释放穿透性能量波，彩虹魔杖可召唤追踪敌人的彩虹投射物。
经济价值是水晶碎块的另一重要特性。单组（999个）水晶碎块售价达159984金币，是困难模式高效的赚钱手段。若搭配妖精尘制作强效治疗药水，收益可提升至单个水晶碎块价值30金币，使用炼药桌更可增至45金币。这种加工方式比直接出售原料多137%利润，适合需要快速积累资金的玩家。
以目标图格为中心的13×13区域内需少于2个其他水晶碎块才能生长，且仅能在洞穴层以下的珍珠石或粉冰雪上自然增殖。高效农场需每3格放置一排珍珠石，配合制动器切换激活状态以优化空间。液体环境（水或熔岩）可加速生长，但背景墙存在不影响其发育。
