首先需要找到藤原俊子身旁墙上的启动开关，激活后观察周围地板上的特殊字符，这些字符与藏宝图标注的顺序一致。启动开关后按照藏宝图顺序踩踏地板，通常需要以一笔画形式点亮所有地板，确保顺序不乱。完成初次解谜后，地下室门会开启，但部分场景会触发二次机关变化，需重新启动开关并按照新出现的图案调整踩踏顺序。
进入地下室后可能遇到雷屏障阻挡，需在附近高台获取雷种子穿过屏障。部分解谜需要调整雷灯序列，例如绀田村井底的雷灯解谜需根据鸟居下方镇图提示，将最亮点设为1号位，按连线递增顺序调整其他雷灯数量。蛇神之首区域的铁门解谜需先找到周围两个雷灵，引导至蛇神骨骸眼睛处激活机关。部分场景还需击败落武者或野伏众等敌人才能继续解谜流程。
清籁旧宝任务的地下室解谜分为两个阶段，第一阶段需按特定顺序踩踏发光地板，第二阶段需重新启动机关后遵循新图案完成一笔画路径。八酝岛蛇神之首密室的拉杆机关需按固定顺序操作：以角色站位为基准，顺序为左上、右下、右上、左下。部分解谜伴随战斗环节，例如击败盗宝团、野伏众或愚人众后才会解锁后续机关。
鸣神大社地下室需通过隐藏任务诡谲的御神签解锁，连续四天完成玄冬林檎发布的击败怪物任务后，返回神社触发剧情进入。荒废神社解谜需从绀田村东北方入口进入，结合留念镜道具观察小狐狸石像获取线索。部分地下室藏有锈蚀钥匙等重要道具，需用雷元素攻击打破特殊石块或完成元素方碑挑战才能获取。稻妻地下室普遍存在多层解谜机制，完成初始解谜后往往需要再次启动机关应对变化后的图案。建议携带菲谢尔或九条裟罗等雷元素角色，便于快速激活雷属性机关。
